Orientado al desarrollo de herramientas de manejo de información para la toma de decisiones, la mantención de un adecuado control del uso de los recursos transferidos, el control de los resultados de productividad de cada proyecto y el apoyo al desarrollo exitoso de cada proyecto. Los procesos considerados son:
- Sistemas de Información
- Seguimiento Administrativo-Financiero
- Seguimiento Técnico-Científico
- Apoyo a la gestión de CR
En cuanto a las actividades de seguimiento de Centros Regionales, tanto en los aspectos administrativos-financieros como técnico-científico, la labor del ACR se ha orientado a generar un Sistema de Seguimiento que considere todos los ámbitos en los cuáles se desarrolla la actividad de cada CR, para lo cuál se ha definido un modelo de vínculos para cada CR. El Sistema de Seguimiento y Control se desarrollará con el objetivo fundamental de permitir el flujo de información actualizada que se genera, modifica y/o fluye a través de procesos administrativos, y de ese modo velar por el buen uso de los recursos fiscales y la gestión de los Centros Regionales, los proyectos asociados a cada Centro Regional y el Programa Regional de CONICYT. Con un sistema de acceso en línea, se espera contar con datos actualizados que posibiliten realizar el seguimiento y control de la producción científica, así como de la gestión contable y financiera de los Centros Regionales. Al mismo tiempo, el sistema permitirá el seguimiento y control de los proyectos individuales asociados a los Centros Regionales que tengan dependencia económica con CONICYT y/o otras inversiones públicas. Otro aspecto relevante del sistema en línea es que permitirá la elaboración de indicadores de control que apoyen en la toma de decisiones en la gestión integral de los Centros Regionales y sus diferentes aspectos operativos. | 
