El Centro de Ingeniería de la Innovación (CIN), se crea tras el Cuarto Concurso de Creación de Centros Regionales de Desarrollo Científico y Tecnológico realizado el año 2006 y comienza su trabajo el año 2007. El CIN surge asociado al Centro de Estudios Científicos (CECS) de Valdivia, en la Región de Los Ríos. Su misión es realizar transferencia tecnológica e innovación desde los dos modelos alternativos de trabajo científico: sciencie push y demand pull. El primero, tiene por objetivo generar un portafolio de posibles áreas aplicadas y generar o promover el desarrollo tecnológico necesario para realizar una aplicación comercial, en tanto que el segundo requiere la instalación de capacidades para identificar necesidades de los Clusters productivos y trabajar en la búsqueda de soluciones, con el objetivo de disminuir los riesgos de aplicación y los costos de inversión. Sus áreas de investigación, si bien son las mismas que posee el CECS, difieren en la orientación de sus estudios. | 
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