En el Concurso Regular 2008 del Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico, el Centro de Estudios del Cuaternario de Fuego Patagonia, se adjudicó los cuatro proyectos con los que concursó. De hecho, de las universidades y centros que postularon a financiamiento de este concurso, (más de 60 entidades a nivel nacional) el CEQUA fue el único que tuvo 100% de efectividad con más de un proyecto presentado, es decir, presentó cuatro y se adjudicó cuatro. Esto significa aproximadamente un monto de $500 millones de pesos, a utilizarse en un plazo de cuatro años, que es el tiempo que duran los proyectos, para equipamiento y desarrollo de investigación (salidas a terreno, compras de fungibles, desarrollo de tesis de pregrado y magister, análisis, etc.)

Los proyectos que se ganaron son: "Expansión de Alecandrium Catenella en el sur de Chile: ¿Invasión o reconocimiento tardío de la distribución real?". Investigador responsable, Dr. Máximo Frangópulos; "Fluctuaciones de glaciares durante el Holoceno tardío, en el sur de los Andes Chilenos: multicriterio de data aproximada, integrando métodos dendrocronologícos de alta resolución, con liquenometría, tefrocronología y análisis estratigráfico". Investigador responsable, Dr. Juan Carlos Aravena; "Historia vegetacional y climática postglacial de los ecosistemas templados de Patagonia Centro". Investigador responsable, Dr. Rodrigo Villa; "Secuencias de ocupación de cazadores-recolectores marinos en Patagonia austral: descifrando trayectorias tecnológicas y cinegéticas durante los últimos 6000 años". Investigador responsable, Magister. Manuel San Román.

En opinión del Director del Centro, Dr. Máximo Frangópulos, este logro es muy importante, porque "es la herramienta con la cual tus pares evalúan tu trabajo y desempeño científico, pasas a ser parte de la elite científica que con su conocimiento puede aportar al desarrollo del país".

El Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico, FONDECYT, fue creado en 1981, inaugurando la modalidad de fondos concursables introducida por el Estado Chileno como criterio para la asignación de recursos en las áreas de Educación Superior y Desarrollo Científico y Tecnológico.

Su misión es estimular y promover el desarrollo de investigación científica y tecnológica básica en el país. Para ello, incentiva la iniciativa individual y de grupos de investigadores financiando proyectos de investigación de excelencia, sin distinción de disciplinas o procedencia institucional, a partir de una gestión eficiente y basada en la relación permanente y enriquecedora con sus usuarios individuales, colectivos einstitucionales.

El Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico, Fondecyt, es un Programa Público administrado por CONICYT, destinado a estimular y promover el desarrollo de la investigación científica básica en el país.